《指导意见》部署了完善长江经济带绿色航运发展规划、建设生态友好的绿色航运基础设施、推广清洁低碳的绿色航运技术装备、创新节能高效的绿色航运组织体系、提升绿色航运治理能力、深入开展绿色航运发展专项行动等6项主要任务。《指导意见》提出，以绿色航道、绿色港口、绿色船舶、绿色运输组织方式为抓手统筹推进，开展危险化学品运输安全治理等5个专项行动，实现重点突破。

　　《指导意见》明确，到2020年，初步建成航道网络有效衔接、港口布局科学合理、船舶装备节能环保、航运资源节约利用、运输组织先进高效的长江经济带绿色航运体系，航运科学发展、生态发展、集约发展的良好态势基本形成。